Paul Klee viene annoverato tra gli artisti più importanti della prima metà del XX secolo. La sua produzione artistica comprende circa 10.000 opere. Importanti gruppi di opere sono state concepite e realizzate a Berna e dintorni, dove molte opere di Klee sono tuttora conservate presso i discendenti diretti, la fondazione Paul Klee (1947-2004) o presso collezionisti privati. Gran parte di queste opere sono state riunite al Centro Paul Klee per renderle accessibili a un pubblico più vasto.
Con le sue 4.000 opere circa il Centro Paul Klee conserva la collezione più significativa al mondo di dipinti, acquarelli e disegni di Paul Klee, oltre a numerosi documenti di testo e immagini di carattere biografico.