Paul Klee zählt zu den bedeutendsten Künstlern der ersten Hälfte des 20. Jahrhunderts. Sein künstlerisches Lebenswerk umfasst gegen 10'000 Werke. Wichtige Werkgruppen entstanden in Bern und Umgebung, und viele Klee-Werke sind auch hier geblieben – bei den direkten Nachkommen, in der Paul-Klee-Stiftung (1947–2004) oder bei privaten Sammlerinnen und Sammlern. Grosse Teile davon wurden im Zentrum Paul Klee zusammengeführt, um sie einem breiten Publikum zugänglich zu machen.
Das Zentrum Paul Klee verfügt mit gut 4'000 Werken über die weltweit bedeutendste Sammlung von Gemälden, Aquarellen und Zeichnungen Paul Klees und zusätzlich über zahlreiche biografische Text- und Bilddokumente.